本来我国有官方的一二三级甲乙丙的医院等级的评定，但是光北京就有48家三甲医院，在“三级特等”级别的医院被评出以前，这个体系的在三甲这个等级无法展现梯度性。看过很多版本的顶尖医院了，几乎都没有出处，以下是复旦大学医院管理研究所分别于对国内知名医院进行的大排名。这个排名不同于以往一些学校排名的以笼统声望（不区分专科）进行排名，或者单一指标导向（如按学术论文发表、一定等级学者数量等）的排名，而是邀请专家同行评议的方式，对每个专科分别进行声誉排名，27个学科的总得分作为专科声誉分，占80%，科研水平占20%，进行总排名。
北京协和医院是集医疗、教学、科研于一体的大型三级甲等综合医院，是国家卫生计生委指定的全国疑难重症诊治指导中心，也是最早承担高干保健和外宾医疗任务的医院之一，以学科齐全、技术力量雄厚、特色专科突出、多学科综合优势强大享誉海内外。在2010、2011、2012、2013、2014年复旦大学医院管理研究所公布的“中国最佳医院排行榜”中连续五年名列榜首。
在中国历史文化名城成都市，锦江万里桥头的华西坝，有一座闻名遐迩的医学城，她就是四川大学华西临床医学院/华西医院。追溯历史，华西医院起源于美国、加拿大、英国等国基督教会1892年在成都创建的仁济、存仁医院；华西临床医学院起源于1914年的华西协合大学医科，是由美、加、英等国教会按西方医学教育模式建立的医学院。1937年抗日战争全面爆发，中央大学、燕京大学、齐鲁大学、金陵大学、金陵女子文理学院内迁成都，与华西协合大学联合办学办医；是时，华西坝大师云集，名家汇萃，学术盛况空前。1938年，有医学院的华大、中大、齐大组建联合医院；1946年，华西协合大学医院在现址全部建成，简称华西医院。
中国人民总医院（301医院）创建于1953年，是集医疗、保健、教学、科研于一体的大型现代化综合性医院。医院担负党中央、和总部首长及部分驻京部队官兵的医疗保健任务，承担各军区、军兵种转送的疑难、危重病人的诊治工作，收治全国各地的患者。医院同时又是医学院，是全军唯一一所医院办学单位。
瑞金医院建于1907年，原名广慈医院，是一所集医疗、教学、科研为一体的三级甲等综合性医院，有着百年的深厚底蕴。医院占地面积12万平方米，建筑面积22.1万平方米，绿化面积4万平方米，核定床位1693张（实际开放1800余张），全院职工3544人，其中医师958余人（正副教授及各类高级科技人员453人）。拥有中国科学院院士陈竺，中国工程院院士王振义、陈赛娟等一大批在国内外享有较高知名度的医学专家，其中王振义院士荣膺2010年度国家最高科学技术奖。
复旦大学附属华山医院创建于1907年，是国家卫生计生委委属医院、复旦大学附属教学医院和中国红十字会冠名的医院，1992年首批通过国家三级甲等医院评审，为全国文明单位，是国内最著名、最具国际化特征的医教研中心之一，也是全国首家通过JCI认证的部属公立医院，在国内外享有很高声誉。
西京医院坐落在美丽的古都西安，为第四军医大学第一附属医院，前身是1939年延安抗战岁月里诞生的中央医院，1954年与原第五军医大学附属医院合并。医院始终秉承践行宗旨、救死扶伤的“使命文化”，勇于争先、不断超越的“创新文化”，精益求精、追求卓越的“精品文化”，公平竞争、和谐发展的“阳光文化”，锐意进取、创新发展，先后获全国百佳医院、全国百姓放心示范医院、全国拥政爱民模范单位、全国抗震救灾英雄集体、全军医院建设先进单位、全军为部队服务先进医院、总后先进师旅团单位和总后先进党委等殊荣。在国内权威部门发布的全国医院综合排名中，医院综合实力跻身全国五强。
北京大学第一医院（简称“北大医院”）位于北京老皇城内，是距离最近的医院，是一所融医疗、教学、科研、预防为一体的大型综合性三级甲等医院，是中央保健基地医院。北大医院创建于1915年，是我国最早创办的国立医院，也是国内首批建立的临床医学院之一。北大医院前身为民国教育部批准北京医科专门学校设立附属诊察所；1946年随北京医学院与北京大学合并，由此得名“北大医院”；此后经历院系调整，2000年北京大学与北京医科大学两校再次合并，医院随之更名为“北京大学第一医院”。2008年成为中央保健基地医院。
复旦大学附属中山医院是国家卫生和计划生育委员会预算管理单位，是复旦大学的附属综合性教学医院。医院开业于1937年，是当时中国人管理的第一所大型综合性医院，隶属于国立上海医学院，为纪念中国民主革命的先驱孙中山先生而命名为孙中山纪念医院，后更名为中山医院。解放后曾称上海第一医学院附属中山医院和上海医科大学附属中山医院，2001年用现名。1991年12月经卫生部批准，成为上海市第一批三级甲等医院。
中山大学附属第一医院（简称中山一院）是国家重点大学———中山大学附属医院中规模最大、综合实力最强的附属医院，始建于1910年，前身为广东公医医学专门学校附设公医院，2001年更名为中山大学附属第一医院，现为国家三级甲等医院和国家爱婴医院，由院本部、黄埔院区和惠亚医院三个院区组成，是华南地区医疗、教学、科研、预防保健和康复的重要基地，素以“技精德高”在我国和东南亚一带久负盛名，2004年被评为“香港人最信赖的中国内地医疗机构”。
北京大学人民医院创建于1918年，是中国人自行筹资建设和管理的第一家综合性西医医院，最初命名为“北京中央医院”，中国现代医学先驱伍连德博士任首任院长。北京大学人民医院的发展历程，是中国医学进步的见证。医院成功进行了亚洲第一例、世界第四例异体同基因骨髓移植，诞生了中国第一支乙肝疫苗和中国第一台体外震波碎石设备，为中国医疗卫生事业的发展做出了重要的贡献。
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