济南有山东大学齐鲁医院、山东省立医院、山东第一医科大学第一附属医院等。山东大学齐鲁医院在海内外享有盛誉，在复旦版《2021年度中国医院综合排行榜》中排名第24。山东省立医院拥有多个国家临床重点专科、省医药卫生重点学科，在复旦版榜中排名第52；山东第一医科大学第一附属医院荣获“全国百姓放心示范医院”称号，入围全国综合性医院立项国自然项目数量百强。
山东大学齐鲁医院是国家卫生健康委委属(管)的三级甲等综合医院，打造形成了门类齐全的学科体系、实力雄厚的人才队伍和国内先进的医疗、教学、科研平台，在海内外享有盛誉。在2021年发布的复旦大学中国医院专科声誉排行榜上，急诊医学、康复医学、妇产科、神经外科、血液学、全科医学6个专科进入全国排名前十，另有10个专科获专科声誉十强提名。该医院在复旦版《2021年度中国医院综合排行榜》中排名第24。
山东省立医院是一所集医疗、教学、科研、预防保健和指导基层等任务于一体的山东省规模最大的综合性三级甲等医院，医院学科齐全，特色专科突出，拥有国家临床重点专科7个，省医药卫生重点学科（重点实验室）12个，省级医学中心18个等，先后荣获“全国卫生系统先进集体”、“全国十佳文明服务示范医院”等荣誉称号。该医院在复旦版《2021年度中国医院综合排行榜》中排名第52。
山东第一医科大学第一附属医院目前已建设成为一所集医疗、教学、科研、康复、保健、预防、急救于一体的省级大型综合性三级甲等医院，并先后荣获“全国百姓放心示范医院”“全国医院文化建设先进单位”等荣誉称号。医院同时入围全国综合性医院立项国自然项目数量百强、全国三级公立医院绩效考核百强、中国医院竞争力排行榜（艾力彼）“顶级医院100强”和“智慧医院HIC100强”。
山东大学第二医院获评全国首家“新三甲”医院(2011版)，入选首批委省共建国家区域医疗中心核心成员单位，医院科室齐全，在学科主流排行榜中，12个学科跻身全国百强，其中检验医学位列全国第八。医院每年获批国家自然科学基金项目等各类课题100余项，先后荣获山东省科技进步一等奖2项、二等奖5项，高居全省医疗机构榜首。
山东省耳鼻喉医院是山东省卫健委直属三级甲等医疗机构、山东省首批重点专科医院，是具有全国辐射力和一定国际影响的国内少数几家大型耳鼻喉专科医院之一，连续12年入选中国耳鼻喉专科声誉排行榜。医院在解决耳鼻咽喉头颈外科疑难复杂危重疾病方面开展了许多创新性工作，拥有一系列国内首创及领先的防治技术，各专科主流技术达到国际先进水平。
山东中医药大学附属医院连续三年在全国公立中医院绩效考核中位列A+等级，位居山东省首位，2020年度位列全国三级公立中医医院第6名。医院为全国最早成立的省级中医医院之一，现已成为一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复于一体的大型三级甲等综合性中医医院，是全国示范中医院、国家中医临床研究基地等。
济南市中心医院是山东省级区域医疗中心，是大型综合性三级甲等医院，拥有全省规模最大的血液透析中心，和国内一流的基础和临床实验室，共承担国家级、省级、市级科研课题300余项，同时在烧伤整形、心脑血管疾病诊治、复杂危重疾病抢救及各种肿瘤疾病诊治等领域均居省内领先水平。
济南市人民医院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、急救为一体，技术精湛、设备先进、专科门类齐全的大型三级甲等综合医院。医院拥有省、市医药卫生系统重点学科14个，济南市重点实验室9个，能够开展腔镜、介入等微创手术，均达到省内同级医院先进水平，极大提升了急危重症患者的抢救能力和抢救水平。
济南市第四人民医院现已成为一所集医疗、教学、科研、急救和预防保健等任务于一体的三级甲等综合医院，是济南市骨科专业、消化内科专业、病案质量专业和临床化学检验专业医疗质量控制中心挂靠单位，是国家级住院医师规范化培训基地、中国心衰中心认证单位、国家高级卒中中心建设单位。
山东省立第三医院是集医疗、教学、科研、预防保健和康复为一体的委直属的三级甲等综合性医院，山东省首批互联网医院、首批医养结合示范单位，其中省级临床重点专科康复医学科、普外科；省中医药临床重点专科中医科持续处于全省领先地位。同时承担着山东中医药大学、潍坊医学院、山东第一医科大学等医学高等院校的专科、本科和研究生的培养、教学任务。
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